Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms