Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm12185Q5NCB2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm12185Q5NCB2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms