Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms