Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DroshaQ5HZJ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms