Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpm3Q5F4S9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpm3Q5F4S9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms