Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkaa1Q5EG47 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms