Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrc3Q5DU56 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms