Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfmbt2Q5DTW2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms