Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtl5Q5DTT4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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