Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufaf2Q59J78 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms