Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms