Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl1Q52KE7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms