Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xirp2Q4U4S6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xirp2Q4U4S6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms