Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem171Q4KL18 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem171Q4KL18 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms