Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc3lQ4KL14 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms