Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brinp3Q499E0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brinp3Q499E0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brinp3Q499E0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brinp3Q499E0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brinp3Q499E0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brinp3Q499E0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brinp3Q499E0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brinp3Q499E0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brinp3Q499E0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms