Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt35Q497I4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms