Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Lin28bQ45KJ6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lin28bQ45KJ6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin28bQ45KJ6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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