Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk4Q3V129 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk4Q3V129 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk4Q3V129 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk4Q3V129 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk4Q3V129 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ulk4Q3V129 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ulk4Q3V129 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ulk4Q3V129 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms