Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc110Q3V125 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc110Q3V125 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms