Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Lrrc43Q3V0L5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc43Q3V0L5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc43Q3V0L5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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