Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930567H17RikQ3V0K5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms