Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms