Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6899Q3USS0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms