Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TceancQ3US16 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TceancQ3US16 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TceancQ3US16 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TceancQ3US16 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TceancQ3US16 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms