Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkain3Q3URJ8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms