Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vwa5b2Q3UR50 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vwa5b2Q3UR50 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms