Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms