Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3UPC7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UPC7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms