Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlrc4Q3UP44 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms