Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Tmem253Q3UNB8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Tmem253Q3UNB8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Tmem253Q3UNB8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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