Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms