Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin1rt1Q3ULQ2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms