Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b2Q3UJB0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms