Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc34Q3UI66 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms