Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lmod2Q3UHZ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod2Q3UHZ5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms