Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms