Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms