Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfgef3Q3UGY8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms