Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms