Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trafd1Q3UDK1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms