Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VwceQ3U515 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms