Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf149Q3U2C5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rnf149Q3U2C5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf149Q3U2C5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf149Q3U2C5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf149Q3U2C5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf149Q3U2C5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf149Q3U2C5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf149Q3U2C5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf149Q3U2C5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf149Q3U2C5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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