Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q3U1D9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms