Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc174Q3U155 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms