Protein–RNA interactions for Protein: Q3U132

Tespa1, Protein TESPA1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tespa1Q3U132 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tespa1Q3U132 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms