Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms