Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp13a5Q3TYU2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms