Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd6Q3TY92 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms