Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms